貓咪毛色演化主要由基因控制，基礎只有黑色素 (eumelanin) 和紅色素 (pheomelanin) 兩種/貓咪毛色多樣性是基因變異、自然選擇（如虎斑的偽裝色）與人類選擇性繁殖的結果。人類偏好某些花色，例如中國曾大量繁殖白長毛藍眼貓，增加了白色貓的比例。

 貓咪毛色演化主要由基因控制，基礎只有黑色素 (eumelanin) 和紅色素 (pheomelanin) 兩種，透過基因調控產生各種花色如虎斑、玳瑁、三花、重點色等，與X染色體（決定橘色）、色素細胞分裂速度（形成花斑）及特定基因突變（如Arhgap36 基因影響橘色表現）息息相關，人類的選擇性繁殖也大大豐富了毛色多樣性。 

基礎色素與基因

基本色素: 貓咪毛色只有兩種基本色素：黑色素（真黑色素）和紅色素（嗜鉻黑色素），其他顏色都是由這兩種色素的濃度、分佈及基因調控產生。

毛色基因位置: 決定毛色的關鍵基因位於X染色體上。

公貓 (XY): 只有一條X染色體，毛色由母系遺傳決定，通常是全色（如全橘或全黑）。

母貓 (XX): 兩條X染色體，若一條帶黑基因、一條帶橘基因，則可能出現黑色與橘色交雜的玳瑁或三花色 (calico)。 

主要花色形成機制

橘色: 橘色基因突變（位於X染色體上的 Arhgap36 基因）讓黑色素細胞製造紅色素。公貓只要帶有此突變就成橘貓，母貓則需同時有兩條帶有此突變的X染色體。

玳瑁/三花: XX母貓體內的 X染色體去活化 (X-inactivation) 導致兩條X染色體上的不同毛色基因同時表現，形成斑塊。

虎斑 (Tabby): 胚胎時期色素細胞的移動與分佈產生條紋。科學研究顯示，這與細胞分裂速度有關，細胞分裂慢的區域會形成深色條紋 (如DKK4 基因)。

白色斑點/全白: 由於色素細胞（黑色素細胞）擴散不足或分裂速度太慢，導致毛髮無法被染色，留下白色區域。

重點色 (Point Color): 例如暹羅貓，出生時為白色，隨著溫度降低，身體末端（耳朵、臉、四肢、尾巴）毛髮顏色才變深，是因為特定基因（如TYR 基因相關）在低溫下才產生色素。 

演化與人類影響

貓咪毛色多樣性是基因變異、自然選擇（如虎斑的偽裝色）與人類選擇性繁殖的結果。

人類偏好某些花色，例如中國曾大量繁殖白長毛藍眼貓，增加了白色貓的比例。 

總之，貓咪的毛色是基因、細胞發育過程與環境（如溫度）共同作用的結果，而人類的喜好也影響了現代貓咪花色的分佈與流行